2004年9月15日国务院批准撤销邕宁县设立南宁市邕宁区

秦以后，今邕宁地属西瓯、骆越地。秦属桂林郡辖地。

汉属郁林郡领方县及合浦郡治合浦县辖地。东汉因之。

三国时代，今邕宁地属吴国辖地。东、北、西境属吴置郁林郡临浦县，南境属合浦郡合浦县。

东晋大兴元年（318年），先设晋兴郡，后置晋兴县，属之。南北朝的宋、齐、梁、陈仍基本沿袭。

隋罢晋兴郡为晋兴县，属简州。开皇十八年（598年）改晋兴县为宣化县，属郁林郡。

唐武德四年（621年），在此置南晋州，初领宣化一县，五年析宣化置武缘、晋兴、朗宁、横山四县。（乾元后省横山）贞观八年（634年）改为邕州。天宝元年（742年）改为永宁郡。乾元元年（758年）复为邕州。长庆二年（822年）于此设邕管经略使。宣化县属之。

宋开宝四年（971年）更晋兴为乐昌，六年省朗宁入宣北，封陵入武缘，如和入宣化。此间，州、郡、及宣化县治均在南宁。

元至元十六年（1279年）邕州改为邕州路。泰定元年（1324年）又改为南宁路。

明洪武元年（1368年）南宁路改为南宁府。清代仍沿袭，宣化县属之。

民国2年（1913年）6月废府改道，宣化县改为南宁县，隶属邕南道。民国3年（1914年）1月改称邕宁县。邕宁县得名之始并延续至今，隶属南宁道，列为甲等县。民国15年（1926年）10月裁道，直属广西省府。民国19年隶属南宁民团区，后设置南宁行政督察专员兼保安司令公署，改隶该公署。

1949年12月4日南宁解放， 25日邕宁县人民政府在南宁宣布正式成立，县府设在今南宁市糖纸厂。1950年12月，县府从南宁迁至蒲庙，设在今人民医院。1951年8月县府迁往五塘，设在今五塘中心小学。1953年1月县府由五塘迁返蒲庙。1951年，邕宁县隶属南宁专区（后改宾阳专区迁往芦圩）。1952年7月，邕宁县改置邕宁专区，12月，设置广西省桂西僮族自治区（1956年3月20日将区改称州），邕宁专区属之。1953年撤销邕宁专区，邕宁县属桂西僮族自治区。1958年3月广西僮族自治区成立后（1965年10月12日将“僮”字改“壮”字），废州设署，邕宁县隶属邕宁专员公署（1958年11月更名为南宁专员公署，1971年专区改为地区）。1983年10月8日经国务院批准归属南宁市。

1996年，邕宁县面积4672平方千米，人口约87万人。辖15个镇、6个乡：蒲庙镇、五塘镇、苏圩镇、吴圩镇、良庆镇、那马镇、那楼镇、南阳镇、伶俐镇、刘圩镇、四塘镇、昆仑镇、大塘镇、南晓镇、那陈镇、百济乡、新江乡、镇龙乡、中和乡、长塘乡、延安乡。县政府驻蒲庙镇。

2000年6月20日，广西壮族自治区政府同意延安、新江、长塘等3个乡改为镇建制，各乡改镇后原辖行政区域不变（桂政函〔2000〕129号）。

2002年末，邕宁县面积4725平方千米。总人口92.6万人。辖18个镇、3个乡：蒲庙镇、良庆镇、吴圩镇、苏圩镇、延安镇、四塘镇、五塘镇、昆仑镇、长塘镇、伶俐镇、南阳镇、刘圩镇、那楼镇、新江镇、那马镇、大塘镇、南晓镇、那陈镇、中和乡、镇龙乡、百济乡。共213个行政村、35个居委会。2003年末全县总人口93.08万人。2004年末全县总人口938834人。南宁市大沙田经济开发区（北区、南区2个居委会）、南宁市沿海走廊经济开发区、南宁市仙湖开发区在辖区内。

2004年9月15日，经国务院批准（国函〔2004〕79号）调整南宁市部分行政区划：撤销邕宁县，设立南宁市邕宁区。将原邕宁县的蒲庙（不含莫村）、新江、那楼、镇龙、百济、中和6个乡镇划归邕宁区管辖，邕宁区人民政府驻蒲庙镇。将原邕宁县的四塘、五塘、昆仑3个镇划归兴宁区管辖。将原邕宁县的长塘、伶俐、刘圩、南阳4个镇和蒲庙镇的莫村划归青秀区管辖。将原邕宁县的吴圩、苏圩、延安3个镇划归江南区管辖。将原邕宁县的那陈镇、大塘镇、南晓镇、那马镇、良庆镇（以及大沙田开发区、沿海经济走廊开发区）划归良庆区管辖。