2002年8月31日国务院批准原县级商州市改设为商洛市商州区

商州区，由商州市、商县、商州、上雒县、上洛侯国、上雒、上鄀、鄀方沿革而来。

夏商（约公元前21世纪至前11世纪）时，为梁州之域。周（约前11世纪至前771）为古鄀国地。据《左传》记载，秦国为将其势力发展到汉江流域去，联合晋进攻鄀国，楚出动申、息之师援鄀，并使子西为商公，秦晋兵始退。

秦孝公二十年（前342），卫鞅破魏有功，封之商於十五邑，号曰“商君”。

秦代（前221至前207），上雒。县治在今商於古道佛诞地寒川佛诞公园孝义古上洛，属关中京畿内史直辖。

西汉（前206～24），上洛县，属弘农郡。

东汉（25～220），上洛县。建武十五年（39）属京兆尹。

三国（220～280），仍名上洛县，属曹魏之京兆郡。

西晋（265～316），上洛县。属司州。泰始二年（266）设上洛郡，领上洛、商县、丰阳三县。

南北朝时期，上洛县。

隋代（581～618），上洛县。

唐代（618～907），上洛县。乾元元年（758）改称商州。初属山南西道，后隶京道。 [5]

五代十国时，上洛县，属商州。

北宋（960～1126），上洛县，属永兴军路商州。

南宋绍兴十一年（1141），宋金和议，秦桧割秦商之半畀金，上洛遂为金有。金代（1115～1234），县名依旧，辖地扩大，为今商州、丹凤、商南、山阳四县地及柞水县南部。隶京兆府路商州。

元至元元年（1264）撤上洛县，由商州直辖。二十九年（1292）分州南一部，另设乾佑县，三十一年撤销。初属安西路总管府，皇庆元年（1312）改隶奉元路。

明代（1368～1644），商州。洪武七年（1374）五月降为县，属华州。成化十三年（1477）三月复升为州。改隶西安府。

清代（1644～1911），商州。清初属西安府，雍正三年（1725）升为直隶州，领商南、洛南、山阳、镇安四县，直隶陕西潼商道。

民国（1911～1949），民国2年（1913）改设商县。24年（1935）在县城设立陕西省第四行政督察区专员公署。

1949年7月12日商县解放。成立商县人民政府，夜村以东地区划归丹凤县。

1988年6月，经国务院批准，撤县设市，名商州市。

2002年8月31日，经国务院批准，商洛市设立商州区，以原县级商州市的行政区域为商州区的行政区域。区人民政府驻南大街。