1988年1月7日国务院批准撤销河源县设立河源市
东江自北向南流经河源市区，新丰江从西向东绕城而过，两江在河源市区东面交汇，使得整个河源市区三面环水，因而得名河源。
先秦时期河源属南越。公元前214年，秦统一岭南。随即，秦始皇将所夺取的岭南地区，设“桂林、象、南海”3个郡，南海郡包括今粤东、粤北、粤中和粤西的一部分，今广东省的大部分地区属南海郡，河源属南海郡。
南朝齐永明元年（483年），龙川析地置河源县，属南海郡。南朝梁天监二年（503年）属梁化郡（治归善县，今惠州市区东北）。
隋唐属循州（治归善县，今惠州市区东北）。
南汉乾亨元年（917年）析循州分置祯州（治归善县，今惠州市区东北）、循州（迁至雷乡县，今龙川佗城），河源地区属循州。
宋天禧五年（1021年）改祯州为惠州。
明洪武二年（1369年）循州并入惠州府。
清因之。
民国二年（1913年），属广东省都督府潮循道，后直属广东省革命政府东江行政委员会。
新中国成立后，先后属东江行政委员会、东江行政专员公署、粤东行政公署、韶关地区、惠阳地区等。
1988年1月7日，国务院批准撤销河源县，设立河源市，辖源城区、郊区、龙川县、紫金县、连平县、和平县。
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